再生波折
公元1085年，宋神宗离世。皇位由年仅十岁的宋哲宗继承。太皇太后摄政后将王安石新法悉数废去，并任用司马光为宰相。如此一来，苏轼便得到了东山再起的机会。他在登州当了五天太守后又很快被召回京城，官拜翰林学士知制诰。在短短的一年零五个月的时间里，苏轼从八品一连飞升了十二个官阶，直至正三品。
然而就在此时，波澜却又再次来袭。那时，太皇太后与宰相二人将王安石变法全盘否定，不过苏轼却有自己的原则，他认为王安石变法虽有不妥，却不应该全盘否定。因为与当政者的政见不合，苏轼主动请辞，就这样，公元1089年，苏轼又被调任为杭州太守。
第三次起落
公元1091年，苏轼再次回朝任吏部尚书。七个月后，他被调任颍州、扬州太守。此后，又分别当了一个月的兵部尚书和九个月的礼部尚书。如此频繁的升职贬职事实上是朝廷矛盾的表现，一方面，太皇太后十分欣赏苏轼，希望能够利用他来制衡新党；另一方面，太皇太后又对他执拗的态度十分不满。
公元1093年，太皇太后去世，十八岁的宋哲宗终于正式亲政。由于先前长期被太皇太后压制，宋哲宗的内心已经有些扭曲。所以他亲政后便展开大规模的政治反扑，疯狂打压元祐党人。而一直受到太皇太后器重的苏轼也成了宋哲宗的打击对象，他先是被调离京城，贬为定州太守，一个月后又被贬至偏远的惠州，两年半后，宋哲宗又再次将他贬到更远的地方——儋州。